Namen in cilji raziskave:
Hitra in zanesljiva identifikacija, npr. morfološko zelo podobnih žuželk oziroma določitev nekaterih bakterij ali virusov, ki sodijo med karantenske škodljivih organizmov (KŠO) in ki odražajo podobne vizualne znake na rastlini ima velik pomen pri izvajanju ukrepov proti njihovemu širjenju. V primeru odreditve inšpekcijskih ukrepov (zavrnitev ali uničenje pošiljk) ali v primeru najdbe KŠO v kmetijski pridelavi ali v naravi v okviru izvajanja preiskav na navzočnost KŠO (npr. izkoreninjenje, obvladovanje sta učinkovitost sprejetih ukrepov in stroški njihove izvedbe lahko povezana tudi s hitro identifikacijo KŠO na podlagi zanesljivih hitrih testov. V zadnjem desetletju se v prakso uvajajo hitri testi oz. testi, ki omogočajo identifikacijo tudi v omenjenih kritičnih primerih in temeljijo na uporabi testo LAMP in/ali določanju DNA črtnih kod. V okviru projekta je bila v prakso uvedena in ob tem validirana uporaba izbranih hitrih testov glede na prisotnost gostiteljskih rastlin in nevarnost širjenja v rastlinski pridelavi ali v naravi na ozemlju Slovenije ali pri uvozu rastlin, rastlinskih proizvodov in drugih predmetov v Slovenijo ter tehnične danosti (obstoj testov in kakovost sekvenčnih podatkov za izbrane organizme).
Cilji:
- določiti KŠO ali skupine KŠO, za katere je smiselna uvedba in uporaba hitrih testov za identifikacijo ob uvozu pošiljk rastlin v Slovenijo (EU) in na mestih rastlinske pridelave v Sloveniji,
- razviti in validirati hitre in zanesljive teste, predvsem na osnovi tehnologije LAMP in/ali določanja DNA črtnih kod, za določen KŠO ali skupino KŠO
- preizkusiti in vpeljati hitre teste v prakso za potrebe inšpekcijskih nadzorov in programov preiskav na navzočnost KŠO
Rezultati:
Tekom projekta so bili uspešno izboljšani postopki preverjanja in uvedbe metod določanja različnih organizmov, predvsem žuželk, s pristopi določanja črtnih kod DNA in testi LAMP. Pridobljeno je bilo večje število referenčnih vzorcev, ki so nujno potrebni za takšno delo. Poleg tega so bili za test LAMP pripravljeni protokoli za končne uporabnike in preverjana dolgoročna obstojnost vnaprej pripravljenih reagentov in kontrol; na ta način je lahko končnemu uporabniku olajšano delo, saj je za izvedbo testa potrebnih le nekaj korakov in ni potrebna nobena specializirana, dražja oprema.
Partnerji projekta:
- Kmetijski inštitut Slovenije
- Gozdarski inštitut Slovenije
- Kmetijsko gozdarska zbornica Slovenije, Kmetijsko gozdarski zavod Nova Gorica
- Univerza v Ljubljani, Biotehniška fakulteta
